替代密码（substitution cipher）的原理可用一个例子来说明。例如，将字母a，b，c，d…，w，x，y，z的自然顺序保持不变，但使之与D，E，F，G，…，X，A，B，C分别对应（即相差3个）。若明文为caesar cipher，则对就的密文为FDHVDU FLSKHU（此时密钥为3）。由于英文字母中各字母的频度早已有人进行过统计，所以根据字母频度表可以很容易对这种替代密码进行破译。目前，替代密码只是复杂的编码过程中的一个中间步骤。 　　转换密码（transposition cipher）则是按照某一规则重新排列消息中的字符的顺序。例如，以CIPHER这个字为规则。我们注意到，在此密钥中的英文字母顺序，C为第1，E为第2，……，R为第6.于是得出密钥的顺序为145326。这就表示在形成密文时，首先读取第1列的字符，然后读取第5列、第4列、第2列、第3列和第6列。明文也以6个字符为一组写在密钥下，如： 　　　密钥　CIPHER 　　　顺序　145326（注：此顺序与密钥等价，但不如密钥便于记忆。） 　　　明文　attack 　　　　　　begins 　　　　　　at two（注：明文的意思是"二时开始进攻"。） 　　这样得出密文为abacnwaittettg kso。接收者按密钥中的字母顺序按列写下按行读出，即得明文。这种密码很容易破译，同样是作为加密过程中的中间步骤。